当事人在收到鉴定人的书面答复后仍有异议的，人民法院应当根据《诉讼费用交纳办法》第十一条的规定，通知有异议的当事人预交鉴定人出庭费用，并通知鉴定人出庭。有异议的当事人不预交鉴定人出庭费用的，视为放弃异议。双方当事人对鉴定意见均有异议的，分摊预交鉴定人出庭费用。鉴定人出庭费用按照证人出庭作证费用的标准计算，由败诉的当事人负担。因鉴定意见不明确或者有瑕疵需要鉴定人出庭的，出庭费用由其自行负担。人民法院委托鉴定时已经确定鉴定人出庭费用包含在鉴定费用中的，不再通知当事人预交。

提出的异议理由可能有以下几点： 1.鉴定人员与案件当事人之间是否存在利害关系；2.鉴定的依据是否合法；3.鉴定的材料是否经过人民法院质证；4.鉴定材料是否齐全；5.鉴定的步骤、方法是否科学；6.鉴定机构、鉴定人员是否具有相应资质；7.目前是否具备鉴定条件等等。

对于一方当事人就专门性问题自行委托有关机构或者人员出具的意见，另一方当事人有证据或者理由足以反驳并申请鉴定的，人民法院应予准许。

（一）鉴定人不具备相应资格的；

（二）鉴定程序严重违法的；

（三）鉴定意见明显依据不足的；

（四）鉴定意见不能作为证据使用的其他情形。

存在前款第一项至第三项情形的，鉴定人已经收取的鉴定费用应当退还。拒不退还的，依照本规定第八十一条第二款的规定处理。

对鉴定意见的瑕疵，可以通过补正、补充鉴定或者补充质证、重新质证等方法解决的，人民法院不予准许重新鉴定的申请。重新鉴定的，原鉴定意见不得作为认定案件事实的根据。

鉴定人应当就鉴定事项如实答复当事人的异议和审判人员的询问。当庭答复确有困难的，经人民法院准许，可以在庭审结束后书面答复。人民法院应当及时将书面答复送交当事人，并听取当事人的意见。必要时，可以再次组织质证。

鉴定人拒不出庭作证的，鉴定意见不得作为认定案件事实的根据。人民法院应当建议有关主管部门或者组织对拒不出庭作证的鉴定人予以处罚。当事人要求退还鉴定费用的，人民法院应当在三日内作出裁定，责令鉴定人退还；拒不退还的，由人民法院依法执行。当事人因鉴定人拒不出庭作证申请重新鉴定的，人民法院应当准许。

经法庭许可，当事人可以询问鉴定人，但不得使用威胁、侮辱等不适当的言语和方式。

《建工解释（二）》第十三条规定：当事人在诉讼前共同委托有关机构、人员对建设工程造价出具咨询意见，诉讼中一方当事人不认可该咨询意见申请鉴定的，人民法院应予准许，但双方当事人明确表示受该咨询意见约束的除外。

咨询报告是咨询机构对建设项目投资、工程造价的确定与控制提供专业咨询服务所出具的专业意见，本质上是作为受托人的咨询机构按约定向作为委托人的当事人交付的工作成果。由于咨询机构的设立不需要具备硬性资格条件，其出具咨询意见客观性和专业性无法得到保证。在当事人未约定愿受其约束的情况下，其中一方当事人对咨询意见不服而提出异议时，不需要进行举证。若当事人之间未曾约定将咨询意见作为工程结算的依据，则即使存在咨询意见也不影响当事人提起鉴定。（完）